A Bolyai Collegium Alapítvány célkitűzése háttérintézményként támogatni a Bolyai Farkas Elméleti Líceum és a Református Kollégium tevékenységét, illetve biztosítani diákjainak, pedagógusainak és a szülői közösségnek azokat az eszközöket, amelyek révén az oktatás, az információcsere valós értékű, a mai és a jövő elvárásainak megfelel.Az infrastrukturális fejlesztések mellett célunk olyan pedagógus–diák–szülő közösség összekovácsolása, amely nemcsak méltó a Bolyai szellemiség örökségére, hanem példamutatással és véleményformáló erejével meghatározó erő a helyi és erdélyi magyarságnak.